- 专利标题 公开号/公告号 公开日期 摘要 专利状态
- 基因测序数据解压方法、系统及计算机可读介质 CN201710982666.5 2020-10-20 本发明公开了一种基因测序数据解压方法、系统及计算机可读介质，解压方法包括遍历获取待解压读序列Rc，针对每一条待解压读序列Rc解压重构为正负链类型d、k位原始基因序列CS1和可逆运算结果CS2；以CS1作为初始的短串K‑mer通过预测数据模型P1获取相邻位对应的预测字符c，滑动窗口迭代获取预测字符集PS，将CS2、PS编码后通过可逆函数的反函数进行逆向运算解密；将CS1、解密结果组合得到读序列R。本发明具有压缩率低，解压时间短，解压性能稳定的优点，不需要对基因数据进行精准比对，有较高的计算效率，预测数据模型的预测准确度越高，则可逆运算结果中的重复字符串就越多，压缩的压缩率就越低。 专利权的授权
- 基因测序数据压缩预处理方法、系统及计算机可读介质 CN201710982649.1 2020-10-23 本发明公开了一种基因测序数据压缩预处理方法、系统及计算机可读介质，方法实施步骤包括获取参考基因组数据，获取短串K‑mer及其预测字符c之间的映射关系，得到包含参考基因组的正链及负链中任意短串K‑mer及其对应相邻位的预测字符c的预测数据模型P1；系统为包含编程以执行前述方法的计算机系统，计算机可读介质包含执行前述方法的计算机程序。本发明能够面向无损基因测序数据压缩的参考基因组数据预处理方法，为基因测序数据的高性能无损压缩和解压算法提供充分有效的信息，能够实现对任意基因组数据样本中的短串K‑mer的相邻位的预测字符c进行预测，预测信息越准确，则可以实现对基因组数据样本实现越低的压缩率。 专利权的授权
- 比对型基因测序数据解压方法、系统及计算机可读介质 CN201710982851.4 2022-12-02 本发明公开了一种比对型基因测序数据解压方法、系统及计算机可读介质，解压方法包括遍历获取待解压读序列Rc，针对每一条待解压读序列Rc解压重构为正负链类型d、k位原始基因序列CS1和可逆运算结果CS2；以CS1作为初始的短串K‑mer比对参考基因组获取预测字符c，滑动窗口迭代获取预测字符集PS，将CS2、PS编码后通过可逆函数的反函数进行逆向运算解密；将CS1、解密结果组合得到原始读序列R。本发明具有压缩率低，解压时间短，解压性能稳定的优点，不需要对基因数据进行精准比对，有较高的计算效率，压缩时比对准确度越高，则可逆运算结果中的重复字符串就越多，从而压缩的压缩率就越低。 专利权的授权
- 一种全基因组测序数据计算解读方法 CN201710362124.8 - 本发明公开了一种全基因组测序数据计算解读方法，实施步骤包括：输入用于全基因组测序的参考全基因组数据、原始测序样本数据并进行预处理；由CPU调用FPGA加速将测序样本可靠数据和带索引的参考全基因组数据进行比对，得到具有重复标志、带索引的比对结果；由CPU调用FPGA和GPU加速对测序样本可靠数据进行基因组重新装配，并对具有重复标志、带索引的比对结果进行变异识别发现；由CPU调用GPU和DSP加速进行可视化处理，并基于可视化处理结果由CPU调用FPGA上硬件实现的深度学习模型进行全基因组及变异功能的分析和挖掘。本发明能够综合利用GPU、DSP、FPGA处理器进行加速，具有快速实时、精准深入、通俗易懂、形式多样的优点。 专利申请的驳回
- 一种转录组测序数据计算解读方法 CN201710362095.5 - 本发明公开了一种转录组测序数据计算解读方法，实施步骤包括：输入参考基因组数据、参考转录组数据和原始的测序样本数据并进行预处理；基于CPU调用FPGA上硬件实现的比对器进行比对，将可靠测序样本数据重新装配成转录本；基于CPU调用GPU上编程实现的识别器对可靠测序样本数据和参考基因组数据及其比对结果进行转录本识别，对可靠测序样本数据和参考转录组数据及其比对结果进行转录本识别；基于CPU调用GPU和DSP进行可视化处理，通过CPU调用FPGA上硬件实现的深度学习模型，进行指定的数据挖掘和分析。本发明具有转录组测序数据计算解读快速实时、精准深入、通俗易懂、形式多样的优点。 专利申请的驳回
- 一种DNA甲基化测序数据计算解读方法 CN201710362178.4 2018-12-11 本发明公开了一种DNA甲基化测序数据计算解读方法，实施步骤包括：对用于DNA甲基化测序的参考基因组数据和原始的测序样本数据进行预处理；通过CPU调用FPGA上硬件实现的比对器将预处理后的测序样本数据和参考基因组进行比对；通过CPU调用GPU上编程实现的识别器、FPGA上硬件实现的深度学习模型，基于比对结果进行甲基化识别；对结果数据进行可视化，通过CPU调用FPGA上硬件实现的深度学习模型对结果数据反映的甲基化功能进行挖掘和分析，且CPU调用GPU上编程处理分析挖掘相关的视频、动画和显示任务，CPU调用DSP上编程处理和分析挖掘相关的图形、图像和音频任务。本发明具有快速实时、精准深入、通俗易懂、形式多样的优点。 专利权的授权
- 一种面向混合云计算平台的协同服务方法 CN201710152464.8 2019-02-15 本发明公开了一种面向混合云计算平台的协同服务方法，用户向第一节点中的客户端守护进程发送推/拉端口请求，客户端守护进程将推/拉端口请求通过互联网发给待提供服务程序协同服务的第二节点；针对推端口请求，第二节点在针对推端口请求验证用户通过后在本地建立云端服务代理，第一节点中的服务程序通过云端服务代理为第二节点中的客户应用程序提供协同服务；针对拉端口请求，第二节点在验证用户通过后，第二节点中的服务程序通过第一节点中的客户端守护进程为第一节点中的客户应用程序提供协同服务。本发明技术方案能够突破不同VPC中的访问限制，最小程度的暴露同时对访问进行严密监控和审计，实现了混合云协同，同时保证了私有云的安全性。 专利权的授权
- 一种基于对象存储的大型数据云存储方法 CN201710146689.2 2019-04-05 本发明公开了一种基于对象存储的大型数据云存储方法，实施步骤包括：客户端读取待存储大型数据文件并形成至少一种数据子流，分别在内存中不断累积形成固定大小的数据块，一边将数据块及其描述信息压缩形成输出实例，一边将输出实例发送给云平台；云平台建立包含块容器对象的根容器对象，一边接收客户端针对待存储大型数据文件发送的输出实例，一边将接收到的输出实例作为对象保存到对应的根容器对象中，且各个数据子流的输出实例保存在一个以上块容器对象中。本发明基于分流分块并发压缩的思想，支持数据压缩及传输上云同步进行的方式、支持对不同数据子流的数据块采取极具针对性的压缩方案，能大量节约数据上传的时间成本与数据存储的经济成本。 专利权的授权
- 人KRAS基因多点突变单管联检荧光PCR方法、试剂盒及体系 CN201710090387.8 2019-09-10 本发明公开了一种人KRAS基因多点突变单管联检荧光PCR方法、试剂盒及体系。方法包括：在荧光PCR体系中，以含有人KRAS基因突变位点的DNA作为模板进行荧光PCR反应，其中荧光PCR体系中包括：用于检测KRASGly12Asp突变位点的上游引物序列、用于检测KRAS各种突变位点的下游引物序列、用于检测KRAS各种突变位点的荧光探针序列；Taq酶、UNG酶、dNTPs、dUTP、Mg2+和PCR缓冲液；第一添加剂和第二添加剂，第一添加剂包括牛血清白蛋白，第二添加剂包括二甲基亚砜、NH4Cl和山梨糖醇水溶液。本发明能够在单管PCR反应中联合检测KRAS基因第12位和第13位密码子上的7种热点突变。 专利权的授权
- 基于ARMS-PCR法检测人外周血游离DNA中septin9基因甲基化的荧光PCR试剂盒及体系 CN201710090052.6 2019-10-11 本发明公开了一种基于ARMS‑PCR法检测人外周血游离DNA中septin9基因甲基化的荧光PCR方法、试剂盒及体系。方法包括：(a)对含有septin9基因的人外周血游离DNA中的CpG位点进行转换处理，使得未甲基化的CpG位点转换为UpG；(b)以转换处理后的人外周血游离DNA作为模板进行荧光PCR反应，荧光PCR体系中包括：用于检测septin9基因甲基化的特异性引物及其探针序列，Taq酶、UNG酶、dNTPs、dUTP、Mg2+和PCR缓冲液，第一添加剂和第二添加剂，其中第一添加剂包括牛血清白蛋白，第二添加剂包括二甲基亚砜、NH4Cl和山梨糖醇水溶液。本发明的方法能够避免1个CpG位点甲基化代表整个基因甲基化水平的假阳性现象；甲基化水平检测限低至1％，灵敏度高。 专利权的授权