- 专利标题 公开号/公告号 公开日期 摘要 专利状态
- 用于口腔癌前病变风险预测的微生物菌群及应用 CN201811136938.0 2022-06-28 本发明公开了用于口腔癌前病变风险预测的微生物群及应用，发明人基于测定的总计127个健康对照、124个口腔癌前病变粪便样本测序数据的分析，鉴别出其中的菌群分类标记物。基于本发明的微生物群，可以有效预测口腔癌前病变风险。基于本发明微生物群开发的诊断试剂，可以有效预测口腔癌前病变风险，检测过程无创，安全性高。同时因为菌群样本可以常温运输，大大提高了检测的方便性。 专利权的授权
- 用于结直肠癌检测的试剂盒及其应用 CN201811123191.5 2020-01-10 本发明公开了一种用于结直肠癌检测的试剂盒及其应用；其中试剂盒包括引物组合物、探针组合物；引物组合物包括BS‑S9‑F、BS‑S9‑R、BS‑N4‑F、BS‑N4‑R、BS‑SDC2‑F、BS‑SDC2‑R、BS‑ACT‑F和BS‑ACT‑R；探针组合物包括BS‑S9‑P、BS‑N4‑P、BS‑SDC2‑P和BS‑ACT‑P。本发明的试剂盒可应用于结直肠癌检测，具有灵敏度高，特异性高等优势。 专利权的授权
- 基因测序质量行数据压缩预处理、解压还原方法及系统 CN201810392727.7 2021-11-26 本发明公开了一种基因测序质量行数据压缩预处理、解压还原方法及系统，本发明基因测序质量行数据压缩预处理、解压还原的基本原理是从输入的质量行文件或数据块中取出若干列作为索引列，然后对所有的质量行数据重新排列，所有索引列相同的质量行为一组，并按它们在原数据块中的相对位置排列在一起。由于索引列相同的质量行数据往往更为相似，这种数据重组的方式能够将相似的基因测序数据排列在一起，从而提高了数据的局部相似性。本发明不引入额外的存储开销，仅仅通过很小的计算开销实现大的数据窗口内的数据重排列，从而提高压缩效率，本发明适合对基因测序过程中的质量行数据进行压缩预处理，而且数据块越大，优势越明显。 专利权的授权
- 一种容器Dockerfile、容器镜像快速生成方法及系统 CN201810145672.X 2019-04-05 本发明公开了一种容器Dockerfile、容器镜像快速生成方法及系统，容器Dockerfile快速生成方法的步骤包括针对待打包的目标应用程序，运行并对目标应用程序追踪执行，记录目标应用程序在运行过程中的操作系统依赖项、组织构建将目标应用程序打包至容器镜像的所需文件列表，根据将目标应用程序打包至容器镜像的所需文件列表生成用于将目标应用程序打包至容器镜像的Dockerfile文件及其容器镜像文件创建目录。本发明能够自动将任意目标应用程序打包进入容器，完成目标应用程序的可执行最小环境闭包的构建，打包出的容器比手工制作的容器更小，比人工打包方式更快、更便捷，不需要操作人员对应用程序的构成有深度了解，任何人都可以轻松的容器化自己想要的特定应用。 专利权的授权
- 一种尿液保存试剂及其应用 CN201711107815.X - 本申请公开了一种尿液保存试剂及其应用。本申请的尿液保存试剂，包括核酸缓冲液、金属离子螯合剂、防腐剂、细胞固定剂和甲醛淬灭剂；核酸缓冲液为Tris‑HCl，工作pH为7‑8；金属离子螯合剂为EDTA；防腐剂为柠檬酸和/或柠檬酸钠；细胞固定剂选自多聚甲醛、重氮烷基脲、咪唑烷基脲和二乙基脲的至少一种；甲醛淬灭剂选自甘氨酸、赖氨酸、乙二胺和精氨酸的至少一种。本申请的尿液保存试剂，能有效保存尿液中游离DNA，避免其降解，为后续的游离DNA检测奠定基础；能阻止尿液中细胞破碎，减小基因组DNA背景，保障游离DNA检测结果准确性。本申请为尿液样本的保存提供了一种新的试剂，为尿液游离DNA临床检测提供了保障。 专利申请的驳回
- 一种粪便保存试剂及其应用 CN201711107812.6 - 本申请公开了一种粪便保存试剂及其应用。本申请的粪便保存试剂，包括细胞缓冲液、细胞固定剂、金属离子螯合剂和防腐剂；细胞缓冲液为Tris‑HCl，工作pH范围为8‑10；细胞固定剂选自SDS、TritonX‑100和PEG‑2000中的至少一种；金属离子螯合剂为EDTA和/或EDTA‑Na2；防腐剂为NaCl。本申请的粪便保存试剂，通过各组分相互配合，能对粪便中的脱落细胞进行有效保护，避免脱落细胞降解，为粪便中脱落细胞的检测提供了有利条件；并且，添加本申请的粪便保存试剂进行保存的粪便样本，其混合物可以直接用于提取DNA或核酸检测，使用简单方便。此外，本申请的粪便保存试剂，不影响下游的粪便检测。 专利申请的驳回
- 一种微量碎片化DNA甲基化检测文库的构建方法和检测方法 CN201711008744.8 - 一种微量碎片化DNA高通量甲基化检测文库的构建方法和检测方法。本发明的文库构建方法包括：将碎片化DNA与甲基化接头连接，其中甲基化接头上所有的胞嘧啶均为甲基化胞嘧啶，甲基化接头包括长链和短链，长链和短链部分互补形成双链，长链包括测序平台通用序列、单分子标签序列、样本标签序列和测序引物结合序列；对连接了甲基化接头的DNA进行亚硫酸氢钠处理，以将非甲基化的CpG岛中的胞嘧啶C转变为尿嘧啶U；使用特异性引物和通用引物对经过亚硫酸氢钠处理以后的、含有待测CpG位点的目标区域进行PCR扩增富集，得到可用于上机测序的文库。本发明能够对液体活检中取到的微量DNA进行甲基化检测，可以同时定量检测多个抑癌基因的多个调控区的CpG岛甲基化状态。 专利申请的驳回
- 基因测序数据压缩解压方法、系统及计算机可读介质 CN201710999663.2 2020-03-17 本发明公开了一种基因测序数据压缩解压方法、系统及计算机可读介质，压缩方法通过将读序列R和参考基因组进行比对获取等长基因字符序列CS；将读序列R、等长基因字符序列CS编码后通过可逆函数进行可逆运算，将读序列R在参考基因组中的最近似位置p、可逆运算结果作为两条数据流压缩输出，解压方法为压缩方法的逆向处理。本发明能够将压缩率更进一步降低、在获得相对较好的压缩率时算法的压缩/解压时间相对较短、可兼容各种将读序列和参考基因组进行比对的算法，具有压缩率低，压缩时间短，压缩性能稳定的优点，不需要对基因数据进行精准比对，有较高的计算效率，比对准确度越高，则压缩率就越低。 专利权的授权
- 比对型基因测序数据压缩方法、系统及计算机可读介质 CN201710982786.5 2020-07-17 本发明公开了一种比对型基因测序数据压缩方法、系统及计算机可读介质，压缩方法针对基因测序数据样本中的每一条读序列R，选择原始基因字符串CS0，按照顺序生成长度为k的短串K‑mer，依次将短串K‑mer和参考基因组进行比对获取其在参考基因组的正链或负链中相邻位的预测字符c，得到所有预测字符c构成的预测字符集PS；将读序列R的Lr‑k位、预测字符集PS编码后通过可逆函数进行可逆运算；将读序列R的正负链类型d、CS0以及可逆运算结果作为三条数据流压缩输出。本发明具有压缩率低，压缩时间短，压缩性能稳定的优点，不需要对基因数据进行精准比对，有较高的计算效率，比对准确度越高，则压缩率就越低。 专利权的授权
- 基因测序数据压缩方法、系统及计算机可读介质 CN201710982696.6 2020-07-24 本发明公开了一种基因测序数据压缩方法、系统及计算机可读介质，压缩方法包括遍历获取读长为Lr的读序列，针对每一条读序列生成短串K‑mer，选择原始基因字符串CS0并确定正负链类型d，通过预测数据模型P1获取每个短串K‑mer的预测字符c得到预测字符集PS，将读序列R的Lr‑k位、预测字符集PS编码后通过可逆函数进行可逆运算；将读序列R的正负链类型d、CS0及可逆运算结果压缩输出。本发明具有压缩率低，压缩时间短，压缩性能稳定的优点，不需要对基因数据进行精准比对，有较高的计算效率，预测数据模型P1的预测准确度越高，则可逆运算结果中的重复字符串就越多，压缩的压缩率就越低。 专利权的授权