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一种用于粪便核酸检测的结直肠癌辅助诊断试剂盒及其使用方法 CN201911165620.X 2023-04-18 本发明公开了一种用于粪便核酸检测的结直肠癌辅助诊断试剂盒及其使用方法，所述试剂盒包括：KRAS基因突变检测试剂、具核梭杆菌检测试剂、DNA亚硫酸盐转化试剂以及Septin9、SDC2、HOXA11和NDRG4基因甲基化检测试剂；所述使用方法为采集粪便样本后使用试剂盒中试剂完成样本的DNA纯化、KRAS基因突变检测、具核梭杆菌丰度检测以及Septin9、SDC2、HOXA11和NDRG4基因甲基化检测，所得数据通过逻辑回归模型计算后进行结果评估及分析。本发明检测结直肠癌的灵敏度达到89％以上，特异性达到94％左右，能够实现结直肠癌高灵敏度和高特异性的检测，能够帮助医生指导病人后续治疗用药。 专利权的授权
一种基因甲基化的检测方法和应用 CN201911128381.0 - 本发明公开了一种基因甲基化检测方法，通过用限制性内切酶BstUI消化含有目标基因的待测样品，然后对酶切产物进行PCR扩增，根据PCR扩增结果判断目标基因的甲基化情况。本发明方法通过对PCR引物的独特设计，大大提升了基因甲基化检测的灵敏度和特异性。 专利申请的驳回
一种改善扩增特异性和均一性的多重PCR方法 CN201910908884.3 2023-04-18 本发明属于核酸检测技术领域，具体涉及一种改善扩增特异性和均一性的多重PCR方法。该方法包括：从样本中提取基因组DNA；将所提取到的基因组DNA进行片段化，并进行纯化；以经纯化的基因组DNA为模板，使用多个特异性引物对，进行PCR扩增反应，其中，在所述PCR扩增反应中，使用由低到高的差异化温度进行退火。本发明对DNA片段化并纯化处理，可以使模板与引物快速结合，提高引物使用率。先在较低的退火温度模式下，让扩增引物充分结合到模板DNA上，再逐步提高退火温度，提高各引物结合的特异性；这使得多重PCR的扩增特异性和均一性得到明显改善。 专利权的授权
基于词频的文本特征加权及短文本相似性计算方法、系统和介质 CN201910864611.3 2023-02-28 本发明公开了一种基于词频的文本特征加权及短文本相似性计算方法、系统和介质，本发明基于语料库进行词频统计实现基于词频的文本特征加权，可以用于自然语言处理领域中多个任务。比如文本分类，关键词提取，相似度计算等任务；本发明基于词频的文本特征加权进一步提供文本相似度的计算方法，通过给予文本中的词不同的权重，实现信息的非线性分布，能够提高文本的相似度计算的准确率，这种权重设计能够降低词频低的词的权重，同时也能够赋予词频高的词的较低的权重，增加中间段词频的词的权重，减少词频低的词和词频高的词对整个文本向量的影响，提高文本间的相似度计算的准确率。 专利权的授权
SAM及BAM文件的无参考序列压缩及解压还原方法、系统和介质 CN201910789674.7 2022-03-15 本发明公开了一种SAM或BAM文件的无参考序列压缩及解压还原方法、系统和介质，本发明无参考序列压缩方法包括遍历读取SAM或BAM文件获得当前行，进行域切割并根据当前行的CIGAR域数据并结合SEQ域数据还原出当前行对应的真实参考序列；将还原出来的真实参考序列更新到当前行在影子参考序列的对应位置，将当前行进行分组计算差异信息并压缩至目标压缩文件，最终将影子参考序列压缩至目标压缩文件；解压还原方法为前述压缩方法的逆向操作；本发明能够在保持压缩率基本不受影响的前提下实现SAM或BAM数据无基因参考序列的加压和解压，且数据的压缩是完全无损的，使用起来非常快捷方便。 专利权的授权
SAM及BAM文件CIGAR域的压缩及解压还原方法、系统和介质 CN201910789642.7 2022-12-02 本发明公开了一种SAM及BAM文件CIGAR域的压缩及解压还原方法、系统和介质，本发明从压缩前的预处理出发，将一个操作符的CIGAR域数据编码为第一指定内容，跳转执行步骤A6）；将两个操作符的CIGAR域数据编码为只包含其中一个操作符及其数字部分的第二指定内容，将三个及以上操作符的CIGAR域数据编码省略第一个操作符M及其数字部分“\d+M”、最后一个操作符的操作符M得到第三指定内容，结合CIGAR域的特性进行预处理，从而可将CIGAR域的内容按照一定规则预处理以实现CIGAR域的高倍压缩，具有预处理高效快速、压缩比高、压缩效果好的优点，本发明可适用于SAM文件、BAM文件两种格式，具有应用范围广的优点。 专利权的授权
用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒及其使用方法 CN201910689793.5 - 本发明公开了一种用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒及其使用方法，试剂盒包括引物组合物、探针组合物和封闭序列组合物，引物组合物由BS‑N4‑F、BS‑N4‑R、BS‑SDC2‑F、BS‑SDC2‑R、BS‑ACT‑F和BS‑ACT‑R组成，探针组合物由BS‑N4‑P、BS‑SDC2‑P和BS‑ACT‑P组成，封闭序列组合物由BS‑N4‑C和BS‑SDC2‑C组成。使用方法包括采样、提取、转化、检测和结果分析。本发明的试剂盒采用NDRG4基因和SDC2基因的联用检测，以ACTB基因作为内参，实现了结直肠癌和腺瘤的高检出率和高特异性，在使用过程中结果分析高效准确，具有很好的商业价值和现实意义。   专利申请的驳回
一种用于膀胱癌辅助诊断或筛查的试剂盒及其应用 CN201910390129.0 2023-05-02 本申请公开了一种用于膀胱癌辅助诊断或筛查的试剂盒及其应用。本申请的试剂盒包括用于高通量测序检测PTEN、BRAF、PIK3CA和FGFR2四个基因突变情况的引物组合。本申请的试剂盒，灵敏度高、特异性强能有效提升血尿病人膀胱癌的检出率、提升早期发现率，提升病人5年生存率。采用本申请的试剂盒进行膀胱癌辅助筛查，以尿液为检测样本，取样方便，属于无创检测，能提升受检者的接受程度，有利于扩大膀胱癌筛查的覆盖人群，降低中国膀胱癌发生率，为全民健康提供保障。更为重要的是，采用本申请试剂盒进行筛查，可以有效避免阴性患者因行膀胱镜带来的尿路感染、尿路损伤等风险，提高患者的依从性，从而改善就医体验与医患关系。 专利权的授权
无参考基因序列的基因数据压缩及还原方法、系统和介质 CN201910380333.4 2024-08-16 本发明公开了一种无参考基因序列的基因数据压缩及还原方法、系统和介质，本发明提供了采用/不采用影子序列的实现方式，采用影子序列的实现方式建立基因参考序列同长影子序列且初始化为空，针对原始基因数据，首先初始化影子序列，然后通过将原始基因数据和基因参考序列比较动态更新影子序列，并保存原始基因数据与其在影子序列上匹配到的序列之间的差异数据及差异信息，将影子序列、所有的差异信息压缩保存至基因数据压缩文件；不采用影子序列的实现方式则直接保存在基因参考序列上匹配的序列差异数据及差异信息并进行压缩。本发明不需要参考基因序列，其压缩率对比解压需要参考基因序列的方式影响很小，甚至有的数据压缩率还会有所提升。 专利权的授权
基于容器的云计算平台任务处理方法、系统及其应用方法 CN201910010905.X 2019-04-12 本发明公开了一种基于容器的云计算平台任务处理方法、系统及其应用方法，本发明利用容器编排技术基于编程语法来识别解析计算任务中的语法定义，从而实现对计算任务中循环的处理以及计算任务之间的依赖关系处理，通过运行计算子任务Ai的容器，运行结束后将计算结果传输到数据仓库，来完成基于容器的云计算平台任务处理。本发明面向有一定编程能力的用户，提供并行和串行运行算法任务支持，解决了计算子任务之间相互依赖的问题，可根据自身业务自定义任务处理，将计算子任务使用容器结合现有容器资源编排调度完成业务处理，能够有效提高平台实用性及优化平台的资源效能。 专利申请的更正